Fetullahçı Terör Örgütü/Paralel Devlet Yapılanması'nın devletin içine sızmış hücreleri aracılığıyla başlattığı en büyük kumpas operasyonu Yargıtay 16. Ceza Dairesi'nin kararıyla çöktü. Yargıtay, aralarında eski Genel Kurmay Başkanı Orgeneral İlker Başbuğun da bulunduğu 274 sanık hakkındaki İstanbul 13. Ağır Ceza Mahkemesi'nin kararını hem esas hem usül yönünden bozdu.

Yargıtay, F Tipi Çete'nin tertipleriyle hazırlanan ve adına "Ergenekon" denilen davada, Ergenekon terör örgütünün varlığına dair somut delil ortaya konamadığı gerekçesiyle davayı esas yönünden bozdu. Kararda "Ergenekon örgütünün kim tarafından ne zaman nerede kurulduğu, nasıl üye olduğu kanıtlanamamıştır" denildi. Dava sürecinde örgütün lideri ve hiyerarşik yapısı da belirtilmemişti.

Davanın usul yönünden bozulmasına ise, eski Genel Kurmay Başkanı Org. İlker Başbuğ ve İnternet Andıcı Davası sanıklarının Yüce Divan'da yargılanması gerektiği gerekçe gösterildi. Sanık ifadelerinin alınması, aramalar ve delillerin incelenmesi sırasında yapılan usülsüzlükler, hukuksuz dinlemeler ve Danıştay saldırısı ile davanın birleştirilmesi usülden bozmanın dayanağını oluşturdu.

6 yıldan fazla süren dava sırasında bazı sanıklar hayatını kaybederken eski Genelkurmay Başkanı Orgeneral İlker Başbuğ müebbet, Emekli Tuğgeneral Veli Küçük 2 kez ağırlaştırılmış müebbet ve 99 yıl hapis, Tuncay Özkan ağırlaştırılmış müebbet ve 22 yıl 6 ay hapis,  Vatan Partisi Genel Başkanı Doğu Perinçek ağırlaştırılmış müebbet, emekli Orgeneral Hurşit Tolon müebbet, Danıştay saldırısının faili Alpaslan Arslan 2 kez ağırlaştırılmış müebbet, Mustafa Balbay 34 yıl 8 ay, Sinan Aygün13 yıl 6 ay hapis cezasına mahkûm edilmişti.